Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Jmjd8Q3TA59 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Jmjd8Q3TA59 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Jmjd8Q3TA59 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jmjd8Q3TA59 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms