Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colec11Q3SXB8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Colec11Q3SXB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Colec11Q3SXB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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