Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnnm3Q32NY4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnnm3Q32NY4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnnm3Q32NY4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnnm3Q32NY4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms