Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nlrp1aQ2LKU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nlrp1aQ2LKU9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms