Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam178bQ24JP3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam178bQ24JP3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam178bQ24JP3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Fam178bQ24JP3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Fam178bQ24JP3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam178bQ24JP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam178bQ24JP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms