Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc162pQ0VG85 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc162pQ0VG85 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc162pQ0VG85 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc162pQ0VG85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms