Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smim24Q0VG18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smim24Q0VG18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smim24Q0VG18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smim24Q0VG18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms