Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cntnap5bQ0V8T8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cntnap5bQ0V8T8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cntnap5bQ0V8T8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cntnap5bQ0V8T8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms