Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc45a4Q0P5V9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc45a4Q0P5V9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc45a4Q0P5V9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms