Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TrioQ0KL02 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TrioQ0KL02 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TrioQ0KL02 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TrioQ0KL02 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms