Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Znf541Q0GGX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Znf541Q0GGX2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Znf541Q0GGX2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Znf541Q0GGX2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms