Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plac8l1Q08EJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plac8l1Q08EJ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms