Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cass4Q08EC4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cass4Q08EC4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cass4Q08EC4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms