Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssrp1Q08943 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssrp1Q08943 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssrp1Q08943 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssrp1Q08943 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.8 ms