Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calb2Q08331 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Calb2Q08331 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Calb2Q08331 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms