Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgm3Q08189 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tgm3Q08189 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tgm3Q08189 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tgm3Q08189 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1090.6 ms