Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou6f1Q07916 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pou6f1Q07916 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou6f1Q07916 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou6f1Q07916 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms