Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox4Q06831 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox4Q06831 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sox4Q06831 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms