Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp2Q06649 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp2Q06649 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp2Q06649 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms