Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atf4Q06507 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atf4Q06507 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atf4Q06507 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atf4Q06507 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms