Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cab39Q06138 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cab39Q06138 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms