Protein–RNA interactions for Protein: Q05AC5

4930430A15Rik, RIKEN cDNA 4930430A15, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930430A15RikQ05AC5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930430A15RikQ05AC5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930430A15RikQ05AC5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930430A15RikQ05AC5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms