Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs3Q05895 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs3Q05895 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs3Q05895 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms