Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RelbQ04863 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelbQ04863 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RelbQ04863 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RelbQ04863 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms