Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdk16Q04735 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdk16Q04735 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdk16Q04735 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms