Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnb1Q03717 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnb1Q03717 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnb1Q03717 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms