Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Thbs2Q03350 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Thbs2Q03350 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Thbs2Q03350 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms