Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp11Q02853 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp11Q02853 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms