Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna1cQ01815 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cacna1cQ01815 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cacna1cQ01815 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cacna1cQ01815 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms