Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VegfaQ00731 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfaQ00731 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfaQ00731 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms