Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HmmrQ00547 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HmmrQ00547 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HmmrQ00547 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HmmrQ00547 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms