Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pax8Q00288 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pax8Q00288 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pax8Q00288 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms