Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx2Q00262 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx2Q00262 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx2Q00262 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx2Q00262 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms