Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cited1P97769 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cited1P97769 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cited1P97769 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms