Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Taf1bP97358 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Taf1bP97358 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Taf1bP97358 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms