Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rps3aP97351 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rps3aP97351 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps3aP97351 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms