Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mesp1P97309 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mesp1P97309 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mesp1P97309 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms