Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43bP86448 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim43bP86448 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim43bP86448 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms