Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem170bP86050 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem170bP86050 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem170bP86050 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms