Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otx2P80206 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otx2P80206 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx2P80206 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otx2P80206 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otx2P80206 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otx2P80206 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otx2P80206 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx2P80206 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otx2P80206 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otx2P80206 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otx2P80206 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx2P80206 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms