Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UrodP70697 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UrodP70697 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UrodP70697 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UrodP70697 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UrodP70697 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UrodP70697 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UrodP70697 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UrodP70697 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UrodP70697 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UrodP70697 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UrodP70697 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UrodP70697 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UrodP70697 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UrodP70697 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UrodP70697 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UrodP70697 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UrodP70697 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UrodP70697 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UrodP70697 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UrodP70697 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UrodP70697 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UrodP70697 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UrodP70697 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UrodP70697 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UrodP70697 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UrodP70697 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UrodP70697 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UrodP70697 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UrodP70697 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UrodP70697 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UrodP70697 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UrodP70697 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UrodP70697 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UrodP70697 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UrodP70697 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UrodP70697 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UrodP70697 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UrodP70697 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms