Protein–RNA interactions for Protein: P70331

Mdfi, MyoD family inhibitor, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdfiP70331 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MdfiP70331 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MdfiP70331 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MdfiP70331 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MdfiP70331 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MdfiP70331 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms