Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Aup1P70295 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Aup1P70295 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aup1P70295 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Aup1P70295 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Aup1P70295 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms