Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdlim4P70271 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim4P70271 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdlim4P70271 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms