Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC46■■■■■ 4.96
Abcc9P70170 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Abcc9P70170 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC45.93■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC45.9■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC45.88■■■■■ 4.94
Abcc9P70170 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc9P70170 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC45.77■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Abcc9P70170 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC45.72■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC45.71■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Abcc9P70170 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc9P70170 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Abcc9P70170 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms