Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkcbP68404 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkcbP68404 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcbP68404 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms