Protein–RNA interactions for Protein: P62960

Ybx1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx1P62960 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ybx1P62960 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ybx1P62960 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ybx1P62960 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ybx1P62960 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms