Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr2lP62876 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr2lP62876 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr2lP62876 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms