Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lsm5P62322 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lsm5P62322 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lsm5P62322 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lsm5P62322 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms