Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tspan5P62080 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tspan5P62080 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan5P62080 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan5P62080 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms